在出差考勤管理中，员工因公务活动需要加班是很常见的情况。管理者可以通过以下方式处理：
1.明确加班规定：在员工出差前，应明确告知员工加班规定，包括何种情况下需要加班、加班时长和加班报酬等。
2.合理安排工作时间：在安排出差计划时，应尽量合理安排工作时间，避免让员工出现连续加班的情况。
3.及时沟通：如果员工确实需要加班，管理者应及时与员工沟通，了解具体情况，并尽量提供支持和帮助。
4.记录加班情况：对员工的加班情况进行记录，包括加班时间、原因等，以便后续管理和报酬计算。
5.奖励鼓励：对于因公务加班的员工，可以适当给予奖励或者表扬，以鼓励其积极性和工作热情。
例如，某公司的销售团队出差参加展会，由于展会期间工作量较大，员工需要加班处理客户需求。管理者提前沟通加班规定，并根据工作情况灵活调整工作时间，确保团队高效完成任务。在展会结束后，公司对参与加班的员工进行奖励，增强团队凝聚力。
综上所述，管理者在出差考勤管理中，应重视员工因公务活动需要加班的情况，通过明确规定、合理安排、及时沟通、记录情况和奖励鼓励等方式来处理。